image

Service

This section provides basic information about Service

aCGH Analysis

Human Genome CGH Microarrays

The Agilent Human Genome CGH Microarray is a dual color array containing 60-mer oligonucleotide probes synthesized in situ using Agilent’s inkjet SurePrint technology. Its comprehensive probe coverage allows genome-wide DNA copy number variation profiling while focusing on known genes, promoters, miRNAs, pseudoautosomal and telomeric regions.

  • Multiple microarray formats and bundled options available
  • Distinct microarray catalog kits containing regions recommended by ISCA
  • Probes annotated against NCBI Build 37 (UCSC hg19, February 2009)

Comparative genomic hybridization (CGH)는 지놈(genome) 상에 존재하는 CNV(copy-number variations) 연구에 사용됩니다. Agilent사의 CGH microarray technology platform은 암과 유전질환에서 다양한 염색체 이상을 규명하여 새로운 암유전자, 암 억제유전자, 약물표적(drug target), 바이오마커 등의 발굴을 가능하게 합니다.

Comparison of cytogenetic techniques for identifying chromosomal abnormalities.

Types of Agilent Arrays

Resolution에 따라 다양한 종류가 있으며 Human 뿐만 아니라 Mouse, Rat, Chicken에 대한 array가 있고 이외에도 Customize가 가능합니다. High quality의 DNA를 준비해 주시면 최상의 결과를 받아 보실 수 있으며, chip의 종류에 따라 DNA요구량에 차이가 있으니 참고하여 준비 해 주시면 됩니다.

  • Slide Design based on Different Formats

Example for workflow & requirement

Agilent SurePrint G3 CGH Microarrays

  • Benefit
  • Agilent사의 CGH microarray technology platform은 암과 유전질환에서 다양한 염색체 이상을 규명하여 새로운 암유전자, 암억제유전자, 약물표적, 바이오마커 등의 발굴을 가능하게 합니다. Resolution에 따라 다양한 종류가 있으며 Human 뿐만 아니라 Mouse, Rat, Chicken에 대한 array가 있고 이외에도 Customize가 가능합니다.

  • Workflow
  • Sample requirement
  • 1x1M : 3ug
    2X400K : 1.5ug
    4X180K : 1.5ug
    8X60K : 500ng
    DNA 조건: 260/280 1.8~2.0, 260/230 1.5 이상, (gel 상에서) no RNA, no degradation

  • Turnaround timew
  • DNA QC : 2~3일
    Array type 상관없이 4장 기준 : 3~4일



Products

  • SurePrint G3 Human CGH Microarray Kit, 1x1M
  • SurePrint G3 Human CGH Microarray Kit, 2x400K
  • SurePrint G3 Human CGH Microarray Kit, 4x180K
  • SurePrint G3 Human CGH Microarray Kit, 8x60K
  • SurePrint G3 Unrestricted CGH ISCA v2, 4x180K
  • SurePrint G3 Unrestricted CGH ISCA v2, 8x60K
  • Human Genome CGH Microarray 244A Supplemental
  • Human Genome CGH Microarray Kit 105A
  • Unrestricted HD-CGH Microarray ISCA v2, 2x105K
  • Unrestricted HD-CGH Microarray ISCA v2, 4x44k
  • Human Genome CGH Microarray Kit 244A
  • Human Genome CGH Microarray Kit 244A
  • Human Genome CGH Microarray Kit, 4x44K
  • SurePrint G3 CGH ISCA v2 Microarray Kit, 8x60K

Bioinformatics Service

  • Basic analysis
    • CNV analysis software: Agilent Genomic Workbench
    • Algorithm: ADM-1, ADM-2, CBS
    • Aberration summary report ( PDF format file )
    • Aberration report ( EXCEL format file )
  • Advanced analysis
    • 기본 분석 외에 별도로 원하시는 분석방향이 있으시면 분석 담당자와의 전문적인 상담을 통해 분석을 진행하고, 별도의 비용이 청구됩니다.