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Service

This section provides basic information about Service

Overview

Scalable platform

DNA Link는 다양한 SNP genotyping platform을 갖추고 있어 소량의 샘플부터 대량 샘플 분석까지 효율적인 분석이 가능합니다.

Study design service

분석 target SNP을 알려주시면 primer design부터 시작하여 최종 분석결과를 제공 드립니다.

Quality assurance

엄격한 data QC과정을 통해 high resolution, high quality data를 선별하여 신뢰도 높은 결과를 제공합니다.

Workflow (example)

Experiment design

연구 목적에 적합한 SNP 선정 후 샘플 수와 design 가능 여부를 고려하여 platform 선정

Sample Preparation

선정된 platform에서 필요한 샘플 요구량에 맞춰서 샘플 준비. Whole blood나 Buffy coat 샘플은 추출부터 가능

Genotyping

SNP scoring : 기존 연구로 유의성이 밝혀진 SNP을 분석. SNP discovery : Novel한 SNP을 발굴하거나 알려진 SNP의 유무 및 frequency를 확인하는데 이용

Data

Excel 형식으로 제공. SNP discovery의 경우 raw data와 annotation, LD 분석 결과도 함께 제공

Platform

Assay
Platform
Feature
Singleplex
SNaPshotTM assay
ABI 3730xl DNA Analyzer
  • Small sample set 분석 용이
  • Sample requirement : 농도 10ng/ul이상, 5ul.
  • 분석기간 : 3주
TaqMan® assay
ABI PRISM 7900HT real-time PCR system
  • Large sample set 분석 용이
  • Sample requirement : 농도 10ng/ul이상, 3ul.
  • 분석기간 : 5~6주
Multiplex
SNPType assay
Fluidigm BioMark™ System
  • Multiplexed genotyping
    192.24 genotyping – 192 samples X 24 SNPs
    48.48 genotyping – 48 samples X 48 SNPs
    96.96 genotyping – 96 samples X 96 SNPs
  • Sample requirement : 농도 60ng/ul이상, 10ul.
  • 분석기간 : 5~6주
* 분석 소요기간은 의뢰 당시의 일정에 따라 가감 될 수 있으므로 사전에 확인 하시기 바랍니다

Statistical Analysis Service

기본

  • HWE(Hardy-Weinberg Equilibrium)
    - Chi-square Test
  • Major, Minor allele
  • Allele frequency

고급

  • HWE(Hardy-Weinberg Equilibrium)
    Premutation Test
  • Statistical Analysis
    - Association Study
    - Survival Analysis
    - Student's t-Tests10
    - ANOVA
    - Regression Analysis
  ( 별도의 비용이 청구됩니다)