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Service

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Whole Genome Resequencing

Overview

Whole genome re-sequencing 은 reference genome을 가진 종을 대상으로 특정 개체간의 변이를 분석하여 개체나 집단의 염기서열의 비교를 통해 맞춤 의학 연구활용 또는 동∙식물의 분자육종 등 다양한 곳에서 활용 가능합니다.
Whole genome re-sequencing 는 기능적 요소와 관련된 유전적 변이(SNPs, insertions, deletions) 뿐만 아니라 유전체 전반적인 구조적인 변이(inversions, complex rearrangements, copy number variation) 를 확인 할 수 있습니다.

illumina

Workflow Sample requirements
  • Low input(10ng gDNA)
  • PCR-based(100ng or 200ng gDNA)
  • PCR-free(1µg or 2µg gDNA)
Turnaround time

About 4 weeks

10X Chromium

Workflow Sample requirements
  • 200ng HMW DNA(>40Kb)
Turnaround time

About 4 weeks

Bioinformatics

Illumina 10X Genomics Additional Data Report
  1. Whole Genome Sequencing
  2. Germline/Somatic Mutation Analysis
  1. Whole Genome Sequencing
  2. Phased SNVs/indels Analysis
  3. Structure Variant Analysis
  1. Rare Variants Analysis
  2. HLA analysis
  3. Somatic Copy Number Alteration Analysis
  1. Sequencing Summary
  2. Alignment Summary
  3. Depth Coverage Plot
  4. Genotype Calling and SNP detection
  5. Germline & Somatic Variant Summary and Annotation